Dziedziny specjalizacji: Literatura i kultura francuska; Badania nad Renesansem; Oddziaływanie filozofii przednowoczesnej na literaturę; Historia teologii i myśli politycznej; Humanizm, antyhumanizm i Posthumanizm; Humanistyka digitalna oraz e-Learning.

Badania oraz nauczanie akademickie Jana Miernowskiego dotyczą przede wszystkim odpowiedzi literatury na przednowoczesną filozofię, teologię, oraz dyskurs naukowy i polityczny. Jego praca doktorska była poświęcona wypływowi renesansowej logiki na poezję tej epoki. Kolejne monografie dotyczyły relacji pomiędzy literaturą a teologią negatywną średniowiecza i renesansu, ze szczególnym uwzględnieniem sceptycyzmu Montaigne’a. Opublikowana po polsku książka wskazała na prowokacyjny charakter alegorii w literaturze francuskiej od końca średniowiecza po początek XVII w. Najnowsza monografia Jana Miernowskiego analizuje estetykę nienawiści w literaturze francuskiej od renesansu po czasy współczesne. Jego obecne badania dotyczą filozoficznego i estetycznego dialogu pomiędzy humanizmem renesansowym a antyhumanizmem i posthumanizmem. Jan Miernowski pracuje także od lat nad rozwojem elektronicznych narzędzi interaktywnego nauczania interpretacji literackie